Biomedizinische Technik 5 - Vertiefung: Molekularbiologische Methoden für Diagnostik und Therapie
Lehrveranstaltungen:
- VU2 Biomedizinische Technik 5 - Vertiefung: Molekularbiologische Methoden für Diagnostik und Therapie, 2.5 ECTS
Master Mechatronik, Wintersemester, Wahlveranstaltung
Termine: werden auf LFU:online bekanntgegeben (vgl. Lehrveranstaltungsspezifische Verlinkung)
Lernergebnis:
- Grundlegende Kenntnisse der Zellbiologie, Biochemie und Molekularbiologie
- Detaillierte Kenntnisse der wesentlichen analytischen Labormethoden (molekularbiologische Basistechniken und Hochdurchsatzverfahren)
- Grundlegende Kenntnisse von Verfahren zur Datenanalyse und quantitativen Beurteilung diagnostischer Marker und Verfahren
Inhalt:
- Grundlagen der Zellbiologie und Biochemie
- Zelle, Organelle, Zellzyklus
- Stoffklassen und wichtigste Stoffwechselwege
- Grundlagen der Molekularbiologie
- Das humane Genom und seine Variabilität
- Replikation
- Transkription
- Translation
- Post-translationale Modifikationen
- Molekularbiologische Basistechniken
- Eigenschaften und Isolierung von Nukleinsäuren
- Elektrophorese, Blotting, Hybridisierung
- Amplifikation, Klonierung, PCR, RT-PCR
- Klassische Sequenzanalyse (ddNTP, Sanger)
- Quantifizierung (dot blot, qPCR, qRT-PCR)
- Hochdurchsatztechniken
- Mutationsanalyse (DASH, molecular beacons, Chip-basierte Verfahren)
- Next generation sequencing (454, Illumina, Solid, Ion torrent)
- Transcriptomics (Chip-basiert, Transkript-Sequenzierung)
- Proteomics (HPLC, CE, Massenspektrometrie)
- Metabolomics (NMR, HPLC, GC, CE, Massenspektrometrie)
- Biologische Datenbanken (GenBank, dbSNP, OMIM, HapMap, PIR, HMDB, ...)
- Datenanalyse und Beurteilung diagnostischer Verfahren
- S/N ratio, LOD, LLOQ, Linear range, ULOQ
- Verteilungen, Referenzbereiche
- Sensitivität und Spezifität, PPV und NPV
- ROC Analyse
- Uni- und multivariate Statistik und Datenvisualisierung (Tests, Overfitting, Korrektur, PCA, PLS-DA, Volcano-Plot, ...)
Lehrende: Klaus Weinberger